產(chǎn)品名稱:細(xì)菌基因組DNA純化試劑盒(硅膠膜柱法)
英文名稱:Bacterial DNA purification kit(Silica membrane)
產(chǎn)品編號(hào)與包裝規(guī)格:
編號(hào) | 產(chǎn)品類型 | 規(guī)格 |
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TQ001D0 | 分子試劑 | 50 份/盒 |
產(chǎn)品簡(jiǎn)介:用于細(xì)菌基因組DNA的小量提取,其原理是利用細(xì)胞裂解釋放基因組DNA;隨后利用蛋白酶K降解膜蛋白和纏繞DNA的核蛋白,使DNA充分游離;硅膠膜離心過(guò)濾可逆吸附基因組DNA;洗除蛋白質(zhì)、脂質(zhì)等雜質(zhì)后,用洗脫液洗脫獲得高純度基因組DNA。使用本試劑盒提取的DNA可用于各種常規(guī)分子實(shí)驗(yàn)操作,包括酶切、PCR、分子雜交等實(shí)驗(yàn)。
儲(chǔ)存條件及有效期:室溫保存,有效期一年,2~8℃條件下儲(chǔ)存更佳。儲(chǔ)存過(guò)程中若溶液產(chǎn)生沉淀,使用前將其在室溫放置一段時(shí)間或37℃條件下溫育,待充分溶解后搖勻即可使用。
溶菌酶和蛋白酶K溶解后,和RNase一起-20℃存放。
樣本類型:新鮮細(xì)菌培養(yǎng)液或菌落懸浮液。
細(xì)菌基因組DNA純化試劑盒(硅膠膜柱法)試劑盒組成:
序號(hào) | 產(chǎn)品組成 | 規(guī)格 |
1 | 懸浮液 | 17.5 mL |
2 | 裂解液 | 15 mL |
3 | 去蛋白緩沖液 | 24 mL(使用前加16 mL無(wú)水乙醇) |
4 | 漂洗液 | 15 mL(使用前加60 mL無(wú)水乙醇) |
5 | 洗脫液 | 10 mL |
6 | DNA硅膠膜吸附柱 | 50 套 |
7 | 蛋白酶K | 干粉 |
8 | 蛋白酶K配置液 | 1 mL |
9 | 溶菌酶 | 干粉 |
10 | 溶菌酶配置液 | 4 mL |
11 | RNase | 220 μL |
12 | 使用說(shuō)明書(shū) | 1份 |
提取得率:1 mL純培養(yǎng)菌液對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的菌液(107~109 cells)基因組DNA的提取量分別為:革蘭氏陰性菌6~25 μg,革蘭氏陽(yáng)性菌為6~15 μg;OD260/280=1.7~1.9。
細(xì)菌基因組 DNA 純化試劑盒(硅膠膜柱法)使用方法:
● 初次使用前請(qǐng)?jiān)谌サ鞍拙彌_液和漂洗液中加入無(wú)水乙醇,參見(jiàn)瓶身標(biāo)簽或使用說(shuō)明書(shū)。
● 將蛋白酶K的粉末倒入蛋白酶K配置液中,渦旋振蕩充分混勻,濃度為20 mg/mL。
● 將溶菌酶干粉倒入溶菌酶配置液瓶中,渦旋振蕩充分混勻,濃度為20 mg/mL。
1,吸取1~2 mL對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期細(xì)菌培養(yǎng)液于1.5 mL離心管中。12,000 r/min離心1 min,盡量吸除上清。
2,中收集的菌體沉淀加入120 μL懸浮液,充分懸浮后加入80 μL溶菌酶和4 μL RNase A 溶液,震蕩混勻后,37℃水浴10~30 min。
● (革蘭氏陰性菌水浴10~15 min,革蘭氏陽(yáng)性菌水浴20~30 min;若是難提取的葡萄球菌屬細(xì)菌可加入1 μL 溶葡酶 (20 mg/mL)一起水浴。溶葡酶需客戶自行購(gòu)買)
● 對(duì)于難裂解的細(xì)菌如芽孢桿菌和葡萄球菌等,可把懸浮液用量增加至320 μL,和酶水浴后,加入200 mg左右玻璃珠(0.1~0.2 mm)高速渦旋10 min以進(jìn)一步裂解細(xì)菌。靜置1 min,取200 μL上清液至新的離心管中,再進(jìn)行下一步。(玻璃珠需客戶自行購(gòu)買)
3,加入220 μL裂解液和20 μL蛋白酶K,立即渦旋振蕩混勻,65℃~70℃水浴或金屬浴10~15 min,溶液形成清亮的懸浮液。
● 先加裂解液再加蛋白酶K,避免蛋白酶K活性減弱。
● 裂解液加入后會(huì)產(chǎn)生白色沉淀,一般水浴或金屬浴后會(huì)消失,不會(huì)影響后續(xù)提取。如溶液未變清亮,說(shuō)明細(xì)菌裂解不徹底,可能導(dǎo)致DNA提取量減少或不純。如提取菌體超過(guò)1.5 mL,可適當(dāng)延長(zhǎng)溫育時(shí)間。
●( 可選)12,000 r/min離心1 min去除未裂解完全菌體,轉(zhuǎn)移上清液至新的離心管中。
4,加入220 μL無(wú)水乙醇,振蕩混勻,此時(shí)可能出現(xiàn)白色絮狀沉淀,簡(jiǎn)短離心將內(nèi)壁的液體離心到管底。
5,將所得的溶液和絮狀沉淀全部加入DNA硅膠膜吸附柱上(吸附柱套入收集管中),12,000 r/min離心1 min,倒掉濾液,吸附柱套回收集管。
● 溶液中基因組DNA吸附在硅膠膜上,如發(fā)生堵塞,說(shuō)明提取的菌體過(guò)量,應(yīng)適當(dāng)減少菌量或延長(zhǎng)離心時(shí)間,直到所有的溶液順利離心到收集管中為止。
6,加入500 μL去蛋白緩沖液,12,000 r/min離心1 min,倒掉濾液,吸附柱套回收集管。
? 去蛋白緩沖液初次使用前加入16 mL無(wú)水乙醇。
7,加入500 μL漂洗液,12,000 r/min離心1 min,倒掉濾液,吸附柱套回收集管。
? 漂洗液初次使用前加入 60 mL 無(wú)水乙醇。
8,再次加入500 μL漂洗液,12,000 r/min離心1 min,倒掉濾液,吸附柱套回收集管,再次12,000 r/min離心1 min,徹底去除吸附柱中殘留的液體,室溫放置2 min,去除殘留的乙醇。
9,將吸附柱套入新的1.5 mL無(wú)菌的離心管中,向吸附柱中央處懸空滴加50~100 μL洗脫液,室溫靜置5 min,12,000 r/min離心2 min,離心得到的液體轉(zhuǎn)移到無(wú)菌的EP管中,-20℃保存待用。
● 洗脫液可用無(wú)菌去離子水替代,但pH值應(yīng)在8.0~8.5。
● 將洗脫液預(yù)熱到60℃使用,可提高基因組DNA得率。
● 為提高基因組DNA提取得率,可將洗脫得到的溶液再次吸出滴加到吸附柱中央,靜置幾分鐘后再次離心收集。
純度及濃度檢測(cè)分析:
1、提取得到的細(xì)菌基因組DNA片段可用紫外分光光度計(jì)測(cè)量濃度與純度。
2、DNA在OD260處有明顯的吸收峰,在此條件下,1 OD值的光密度相當(dāng)于雙鏈DNA濃度為50 μg/mL;單鏈DNA或2.RNA為40 μg/mL;寡核苷酸為20 μg/mL。
3、OD260/280=1.7~1.9,如果A260/280≤1.7或比值過(guò)低,表示受到蛋白(芳香族)或酚類物質(zhì)污染,需要純化樣品。若DNA樣品中A260/280≥2.0表明樣品有RNA或DNA降解。
4、洗脫液使用去離子水時(shí)候,OD260/280會(huì)偏低,但不表示純度低。
細(xì)菌基因組DNA純化試劑盒(硅膠膜柱法)使用注意事項(xiàng):
1、本試劑盒提取使用的器皿、移液器等均應(yīng)為專用,離心管、槍頭等一次性耗材需進(jìn)行高壓滅菌。操作人員應(yīng)穿戴潔凈工作服、口罩、帽子、使用一次性無(wú)粉手套。
2、使用新鮮培養(yǎng)的菌液,確保提取的基因組DNA不被降解。
3、加入懸浮液后應(yīng)充分懸浮菌液,以免影響提取效果。
4、裂解液注意不要直接接觸皮膚,如有接觸請(qǐng)用大量清水沖洗。
5、去蛋白緩沖液和漂洗液使用后蓋緊蓋子,以免乙醇揮發(fā)影響抽提效果。
6、基因組DNA需長(zhǎng)期保存,建議使用洗脫液洗脫,分裝保存于-20℃或-80℃。
7、請(qǐng)嚴(yán)格按照本說(shuō)明書(shū)操作步驟進(jìn)行,不同批號(hào)的試劑若無(wú)特殊說(shuō)明,請(qǐng)勿混合使用,并保證在有效期內(nèi)使用該試劑盒,因操作不當(dāng)導(dǎo)致的基因組DNA提取效果不佳,本公司概不負(fù)責(zé)。
8、妥善處理所有樣本和試劑材料,徹底清潔和消毒操作臺(tái)面。